複雑系生命システム研究センターは5つの部門からなる。各部門は広域科学専攻の教員が配置され、20名を越える国内外の研究者が連携研究者としてセンターの研究活動に参画している。2016年末に本センターと理学系の生物普遍性機構の共同で、生物普遍性連携研究機構が発足した。これに伴い、駒場キャンパスにおける主力パートナーとして、部局をまたいだ研究・教育活動をより活発化させ、全学ゼミナールの主催、研究サポート、国際学生コンペの支援等に関わっている。連携機構の枠組みで、現在月2回の定期的ミーティングを開催し、また、センター内での研究交流、共同研究の自発的萌芽を促進するため、研究交流セミナーを開催している。
*協力メンバー(東工大地球生命研究所)